Il Museo civico ha sede nell’ex convento di S. Maria delle Monache della cui chiesa romanica, distrutta, restano il portale e il campanile.
Il museo raccoglie i reperti provenienti dal villaggio paleolitico d’Isernia, il più antico insediamento umano d’Europa, con testimonianze relative di vita che l’Homo Erectus (nella fattispecie l’Homo Aeserniensis) si era dato circa un milione di anni fa.
Nei locali sono ospitati anche vari materiali archeologici e romani tra cui dei rilievi.